Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms