Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHI3L1P36222 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHI3L1P36222 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms