Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-FP30511 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms