Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.6 ms