Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HRCP23327 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HRCP23327 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HRCP23327 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HRCP23327 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HRCP23327 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HRCP23327 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HRCP23327 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HRCP23327 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HRCP23327 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HRCP23327 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HRCP23327 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HRCP23327 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms