Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMC1P11047 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC1P11047 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms