Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC166P0CW27 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms