Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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PKHD1P08F94 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PKHD1P08F94 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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