Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSLP07711 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSLP07711 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSLP07711 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSLP07711 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSLP07711 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSLP07711 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSLP07711 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSLP07711 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSLP07711 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms