Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms