Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms