Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DENRO43583 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DENRO43583 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DENRO43583 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DENRO43583 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DENRO43583 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DENRO43583 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
DENRO43583 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DENRO43583 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DENRO43583 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DENRO43583 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms