Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms