Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms