Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms