Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms