Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AFG3L2Q9Y4W6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AFG3L2Q9Y4W6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AFG3L2Q9Y4W6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AFG3L2Q9Y4W6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AFG3L2Q9Y4W6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AFG3L2Q9Y4W6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AFG3L2Q9Y4W6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms