Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PLXND1Q9Y4D7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXND1Q9Y4D7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms