Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM2AQ9Y2K7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM2AQ9Y2K7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM2AQ9Y2K7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM2AQ9Y2K7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM2AQ9Y2K7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM2AQ9Y2K7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM2AQ9Y2K7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms