Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS11EQ9UL52 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS11EQ9UL52 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMPRSS11EQ9UL52 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMPRSS11EQ9UL52 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms