Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms