Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms