Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA4BQ9NPR2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms