Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR88Q9GZN0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms