Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms