Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAGR1Q9BTK6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAGR1Q9BTK6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms