Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CDRT15Q96T59 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CDRT15Q96T59 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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