Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG4Q92954 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms