Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms