Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FAM71DQ8N9W8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FAM71DQ8N9W8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM71DQ8N9W8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM71DQ8N9W8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FAM71DQ8N9W8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FAM71DQ8N9W8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FAM71DQ8N9W8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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