Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC117Q8IWD4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms