Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC80Q76M96 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms