Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP53Q70EK8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP53Q70EK8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP53Q70EK8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP53Q70EK8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP53Q70EK8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP53Q70EK8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP53Q70EK8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP53Q70EK8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP53Q70EK8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP53Q70EK8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP53Q70EK8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP53Q70EK8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP53Q70EK8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP53Q70EK8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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