Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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