Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms