Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms