Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms