Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms