Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms