Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms