Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms