Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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DDB1Q16531 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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DDB1Q16531 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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