Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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RPE65Q16518 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RPE65Q16518 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RPE65Q16518 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RPE65Q16518 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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