Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIK5Q16478 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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