Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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