Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SKIV2LQ15477 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SKIV2LQ15477 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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