Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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