Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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PDCD1Q15116 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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