Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms