Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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